La Cancillería tiene como principal función organizar y custodiar todos los documentos y actas concernientes a la Diócesis de San Felipe, las parroquias y entes canónicos. Desde este organismo se redactan y expiden las actas y documentos referentes a decretos, disposiciones, obligaciones y otros asuntos, dando así fe pública de lo que se expresa o autentifica, de manera que tengan efectos jurídicos.

La cancillería está llamada a velar por el Archivo Diocesano que incluye el Archivo Corriente, el Archivo Temporal y el Archivo Histórico según las normas del Código de Derecho Canónico y de la Santa Sede.